水文水資源研究所的前身是成立于1977年的水利部南京水文研究所，2001年6月科研體制改革，成建制并入南京水利科學(xué)研究院。
水文水資源研究所現(xiàn)有在職職工97人，其中：博士后7人，聘用人員12人。教授級(jí)高工34人，高級(jí)工程師25人，具有博士學(xué)位的46人。擁有水文學(xué)及水資源學(xué)科碩士、博士學(xué)位點(diǎn)和博士后流動(dòng)站，博士生導(dǎo)師10名。水文水資源研究所是水利部頒發(fā)的首批水文水資源調(diào)查評(píng)價(jià)和建設(shè)項(xiàng)目水資源論證甲級(jí)資質(zhì)單位，是水利部應(yīng)對(duì)氣候變化研究中心、水文水資源與水利工程科學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、水利部水科學(xué)與水工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和水利部水文水資源工程技術(shù)研究中心的主要技術(shù)支撐單位；是聯(lián)合國(guó)教科文組織國(guó)際水文計(jì)劃中國(guó)國(guó)家委員會(huì)的主要聯(lián)絡(luò)單位，與聯(lián)合國(guó)教科文組織(UNESCO)、世界氣象組織(WMO)、國(guó)際水文科學(xué)協(xié)會(huì)(IAHS)、國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織(ISO)、國(guó)際原子能機(jī)構(gòu)(IAEA)和聯(lián)合國(guó)開發(fā)計(jì)劃署(UNDP)等機(jī)構(gòu)有著廣泛的學(xué)術(shù)業(yè)務(wù)聯(lián)系。主編的中國(guó)水利學(xué)會(huì)會(huì)刊《水科學(xué)進(jìn)展》，多次獲得“百種中國(guó)杰出學(xué)術(shù)期刊”稱號(hào)。
水文水資源研究所30多年來(lái)，主持承擔(dān)了國(guó)家杰出青年基金、國(guó)家自然科學(xué)基金、“六五”-“十五”國(guó)家科技攻關(guān)計(jì)劃、“十一五”和“十二五”國(guó)家科技支撐計(jì)劃、973、863、國(guó)際科技合作、科技部和水利部重點(diǎn)課題，以及流域和區(qū)域性的水文水資源課題共800多項(xiàng)。開展了水文循環(huán)機(jī)理與氣候變化、暴雨特性與規(guī)律、徑流形成機(jī)制與模擬、洪水預(yù)報(bào)方法、設(shè)計(jì)洪水、水旱災(zāi)害、土壤水實(shí)驗(yàn)等研究；流域和城市防洪規(guī)劃的系統(tǒng)分析理論和方法、流域洪水預(yù)報(bào)和預(yù)警系統(tǒng)、防洪體系的調(diào)度方式和實(shí)時(shí)調(diào)度研究、防洪指揮調(diào)度決策支持系統(tǒng)、洪水風(fēng)險(xiǎn)管理、洪水災(zāi)情評(píng)估系統(tǒng)、防洪減災(zāi)對(duì)策與措施研究；中國(guó)水資源評(píng)價(jià)、中國(guó)水資源利用、洪水資源利用、國(guó)際河流開發(fā)與管理研究、全國(guó)6大流域入河排污口調(diào)查，以及流域及區(qū)域性水資源研究；南水北調(diào)工程規(guī)劃與調(diào)度運(yùn)行、全國(guó)地下水開發(fā)利用規(guī)劃、全國(guó)防洪規(guī)劃等研究工作；人類活動(dòng)對(duì)水文循環(huán)、自然環(huán)境的影響及各類工程對(duì)水環(huán)境的影響評(píng)價(jià)，河流水質(zhì)數(shù)值模擬，水體中污染物的稀釋、擴(kuò)散、遷移規(guī)律及其在水環(huán)境分析、預(yù)測(cè)和水污染治理中的應(yīng)用研究；完成了應(yīng)用3S技術(shù)復(fù)測(cè)水庫(kù)庫(kù)容曲線、水土流失調(diào)查、洪水監(jiān)測(cè)、旱情監(jiān)測(cè)、水下地形測(cè)量、水質(zhì)分析等項(xiàng)目，開發(fā)了防洪決策支持、防汛會(huì)商、水資源管理、水利工程管理等信息系統(tǒng)。近幾年參加了國(guó)家防汛抗旱指揮系統(tǒng)、第一次全國(guó)水利普查河湖基本情況普查、全國(guó)防洪規(guī)劃、全國(guó)水資源綜合規(guī)劃、全國(guó)抗旱規(guī)劃、七大流域綜合規(guī)劃修編、國(guó)家水資源監(jiān)控能力建設(shè)及其它重大項(xiàng)目的技術(shù)工作。先后獲得國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)20余項(xiàng)，省部級(jí)科技進(jìn)步獎(jiǎng)60余項(xiàng)，出版《中國(guó)水旱災(zāi)害》、《中國(guó)歷史大洪水》、《中國(guó)暴雨》、《中國(guó)歷史干旱》、《氣候變化對(duì)水文水資源影響研究》、《河流功能區(qū)劃理論與方法研究》、《同位素水文學(xué)》等專著80多部。
主要研究方向：
◆水文學(xué)理論與方法
◆防洪抗旱與減災(zāi)
◆水資源可持續(xù)利用
◆水資源配置與管理
◆水環(huán)境與水生態(tài)
◆水利信息化
◆應(yīng)對(duì)氣候變化研究
◆國(guó)際河流研究
◆實(shí)驗(yàn)水文研究
