南京水利科學(xué)研究院（Nanjing Hydraulic Research Institute）簡稱南京水科院，是中國綜合性水利科學(xué)研究機(jī)構(gòu)、國家級(jí)社會(huì)公益類非營利性科研機(jī)構(gòu)。
南京水利科學(xué)研究院始建于1935年，原名中央水工試驗(yàn)所，是我國最早成立的綜合性水利科學(xué)研究機(jī)構(gòu)；2001年被確定為國家級(jí)社會(huì)公益類非營利性科研機(jī)構(gòu)。主要從事基礎(chǔ)理論、應(yīng)用基礎(chǔ)研究和高新技術(shù)開發(fā)，承擔(dān)水利、交通、能源等領(lǐng)域具有前瞻性、基礎(chǔ)性和關(guān)鍵性的科學(xué)研究任務(wù)。兼作水利部大壩安全管理中心、水利部水閘安全管理中心、水利部應(yīng)對(duì)氣候變化研究中心、水利部基本建設(shè)工程質(zhì)量檢測(cè)中心、水利部水文儀器及巖土工程儀器質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心。是全國創(chuàng)新人才培養(yǎng)示范基地和全國青少年科技教育基地，榮獲“全國專業(yè)技術(shù)人才先進(jìn)集體”稱號(hào)。
歷經(jīng)80多年的發(fā)展，南京水科院已發(fā)展成為擁有50多個(gè)具有鮮明特色和優(yōu)勢(shì)的專業(yè)研究方向、在國內(nèi)外具有重要影響的水利科研機(jī)構(gòu)。現(xiàn)設(shè)水文水資源研究所、水工水力學(xué)研究所、河流海岸研究所、巖土工程研究所、材料結(jié)構(gòu)研究所、大壩安全與管理研究所、水利部農(nóng)村電氣化研究所、水利部南京水利水文自動(dòng)化研究所、農(nóng)村水利研究所、生態(tài)環(huán)境研究所、海洋資源利用研究中心等研究機(jī)構(gòu)和南京瑞迪建設(shè)科技有限公司等研發(fā)機(jī)構(gòu)。建有水文水資源與水利工程科學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和國家級(jí)國際聯(lián)合研究中心，以及水利、交通、能源行業(yè)9個(gè)部級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、技術(shù)研發(fā)中心、工程技術(shù)研究中心。承辦并定期公開出版8種學(xué)術(shù)期刊（包含英文期刊）。建有院本部科研及科技創(chuàng)新基地、鐵心橋水科學(xué)與水工程實(shí)驗(yàn)基地、滁州水文實(shí)驗(yàn)基地和國家防汛抗旱總指揮部辦公室防洪演練基地、杭州農(nóng)村電氣化與再生能源研發(fā)基地、當(dāng)涂科學(xué)試驗(yàn)及科技開發(fā)基地、無錫河湖治理研究基地。
南京水利科學(xué)研究院立足于水利、交通、能源領(lǐng)域科學(xué)研究和高層次人才的培養(yǎng)，是國家首批相關(guān)學(xué)科博士、碩士學(xué)位授予權(quán)單位，現(xiàn)設(shè)有水利工程一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)、巖土工程學(xué)科博士點(diǎn)，水利工程、土木工程、材料科學(xué)與工程一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)和環(huán)境工程等學(xué)科碩士點(diǎn)，設(shè)有水利工程博士后流動(dòng)站，至今已培養(yǎng)博士、碩士研究生以及博士后近900余人。清華大學(xué)、河海大學(xué)、武漢大學(xué)、四川大學(xué)等國內(nèi)知名高校在我院設(shè)有研究生教育培養(yǎng)基地。2019年成立研究生院，建有研究生教育中心，為研究生學(xué)習(xí)生活提供有良好的保障條件。
