上海海事大學是一所以航運、物流、海洋為特色，具有工學、管理學、經(jīng)濟學、法學、文學、理學和藝術(shù)學等學科門類的多科性大學。2008年，上海市人民政府與交通運輸部簽訂協(xié)議，共建上海海事大學。
上海海事大學研究生教育始于1979年，是我國首批經(jīng)國務(wù)院學位委員會批準有權(quán)授予碩士學位的高等院校之一。1986年7月成立研究生部，2014年4月成立研究生院，負責全校研究生教育和教學管理工作。1994年起具有單獨入學考試招收在職研究生的自主權(quán)；1995年獲準面向港澳臺地區(qū)招收研究生；1996年開始與荷蘭馬斯特里赫特管理學院聯(lián)合培養(yǎng)工商管理碩士（MBA），并獲得外國留學生招生權(quán)；1997年成為全國56所工商管理碩士（MBA）研究生辦學試點單位之一，并獲得在職人員以同等學力申請碩士學位授予權(quán)；1998年成為博士學位授予單位，同年開始招收企業(yè)及經(jīng)濟管理部門管理人員在職攻讀工商管理碩士（MBA）學位，并獲得工程碩士專業(yè)學位授予權(quán)。截至2021年5月，上海海事大學設(shè)有3個博士后科研流動站（交通運輸工程、電氣工程、管理科學與工程），4個一級學科博士點（交通運輸工程、管理科學工程、船舶與海洋工程、電氣工程），17個二級學科博士點，16個一級學科碩士學位授權(quán)點，63個二級學科碩士學位授權(quán)點，13個專業(yè)學位授權(quán)類別。擁有16個省部級重點研究基地。現(xiàn)有1個國家重點（培育）學科，1個上海市高峰學科，2個上海市高原學科，9個部市級重點學科，工程學科進入ESI全球前1%,港航物流學科保持全球領(lǐng)先。5個國家級特色專業(yè)，1個國家級綜合改革試點專業(yè)，6個教育部卓越工程師教育培養(yǎng)計劃專業(yè)?，F(xiàn)有2個國家級實驗教學示范中心，2個國家級虛擬仿真實驗教學示范中心，5個國家級實踐教學示范中心，1個全國示范性工程專業(yè)學位研究生聯(lián)合培養(yǎng)基地。設(shè)有水上訓練中心，擁有4.8萬噸散貨教學實習船“育明”輪。
實行校院二級管理體制，現(xiàn)設(shè)有商船學院、交通運輸學院、經(jīng)濟管理學院（設(shè)亞洲郵輪學院）、物流工程學院（設(shè)中荷機電工程學院）、法學院、信息工程學院、外國語學院、海洋科學與工程學院、文理學院（設(shè)馬克思主義學院）、徐悲鴻藝術(shù)學院、物流科學與工程研究院、上海高級國際航運學院等二級辦學部門。各類在校研究生7200余人，留學生600余名。在1300余名專任教師中，有教授190余名。上海海事大學致力于培養(yǎng)國家航運業(yè)所需要的各級各類專門人才，已向全國港航企事業(yè)單位及政府部門輸送了大量畢業(yè)生，被譽為“高級航運人才的搖籃”。。
上海海事大學與海外100余所姐妹院校建立了校際交流與合作關(guān)系，開展教師交流、合作辦學、合作科研、學生交換等。與聯(lián)合國國際海事組織、波羅的海國際航運公會、挪威船級社等國際知名航運組織/機構(gòu)建立了密切聯(lián)系。自2010年起開設(shè)“國際班”，邀請美國、韓國、波蘭、俄羅斯、德國等國家航海院校的學生來校學習“航海技術(shù)”“航運管理”等專業(yè)。2011年，經(jīng)教育部批準，上海海事大學與加納中西非地區(qū)海事大學合作舉辦“物流管理”本科教育項目，并開始在非洲招生，這是上海市地方高校第一個頒發(fā)中國高校本科文憑的海外辦學項目。2012年，上海海事大學獲教育部批準正式成為“接受中國政府獎學金來華留學生院校”。
